toolsを整理した。cn2Iqとcn2Iq.pyを追加した。

Readme.org

@@ -146,9 +146,10 @@ example/glass.sq was generated.
    -o  --output=%s     Output basename [basename]
    #+end_example
     
-* misc
+* tools
 ** coeffploter.py
-   元素を指定して、原子散乱因子と中性子散乱長をプロットする。
+   元素を指定して、原子散乱因子と中性子散乱長をプロットする。引数に元
+   素名を複数していできる。
 
 ** gr2sq.py
    Qの刻みを変えて再計算するために、dump2sqで生成したgrファイルから
@@ -158,4 +159,23 @@ example/glass.sq was generated.
    $$
    Q = \frac{4\pi}{\lambda}\sin(\theta)
    $$
-   
+   計算した$S(Q)$はpngとxlsxを生成する
+
+** cn2Iq.c
+  dump2sqで生成された*.cnと*.coeffから$I(q)$を計算するCプログラム。
+  openmpでスレッド並列する。f*fは足していない。sincのwindow関数をかけ
+  る。コンパイルは、
+  #+begin_example
+  gcc -fopenmp -O3 -Wall cn2Iq.c  -o cn2Iq
+  #+end_example
+  実行は、*.cnと*.coeffを渡す。I(q)は標準出力に出力されうｒ．
+  #+begin_example
+   ./cn2Iq fort.cn fort.cn.coeff
+  #+end_example
+  複数のcnファイルやxslxに保存したい場合は、cn2Iq.pyを使う。
+
+** cn2Iq.py
+  subprocessでCのcn2Iqを呼び出して、I(Q)のpngとxlsxを生成する。Qの範囲
+  またはthetaの範囲を指定できる。
+ 
+