modified dump2sq, iccの-qopenmpでTHREAD>1でS(Q)がおかしい。調査中

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@@ -26,8 +26,7 @@ https://www.cmu.edu/biolphys/deserno/pdf/gr_periodic.pdf
 
 1ステップ毎に$g(r)$ と$S(Q)$ を計算して最後に時間平均しています。よっ
 て、NPT計算でセルサイズが変わったとしても問題なく計算できます。計算コ
-ストのほとんどは、原子間距離の計算です。この計算はopenmpで並列化してい
+ストのほとんどは、原子間距離の計算です。
-ます。
 
 * 入力ファイル
   拡張子で入力ファイルのformatを判断しています。
@@ -78,15 +77,17 @@ https://www.cmu.edu/biolphys/deserno/pdf/gr_periodic.pdf
 
   [[file:dump2sq-1.0.tar.gz][dump2sq-1.0.tar.gz]]
 
-  
   #+begin_example
   make
   #+end_example
-  icc用のMakefileも準備しています。
+
-  #+begin_example
+  # iccでOMT_NUM_THREAD > 1にすると、S(Q)がおかしくなる。g(r)は正しいのに…。
-  make -f Makefile.icc
+  # 原因不明。Threadは1にしとく。
-  #+end_example
+  # icc用のMakefileも準備しています。
-  これで、dump2sqが生成されます。
+  # #+begin_example
+  # make -f Makefile.icc
+  # #+end_example
+  # これで、dump2sqが生成されます。
    
 * 使い方
   並列計算のために、環境変数をセットしてスレッド数を指定しておく。

dump2sq.c

@@ -261,7 +261,6 @@ void CalcCn_pp(DATA *data, HEAD *head, TYPE *type, DATASET *cn,
 /* ####################################################################### */
 void CalcSq(HEAD *head, TYPE *type, DATASET *gr, DATASET *sq){
   int i, j, k;
-  double r, q;
   double keisuu, sekibun;
   double **sq_;
 
@@ -270,15 +269,15 @@ void CalcSq(HEAD *head, TYPE *type, DATASET *gr, DATASET *sq){
   
   for (i=0; i<sq->n; i++)
     for (j=0; j<sq->m; j++ )sq_[i][j] = 0.0;
-
+  
+  /* X線・中性子の散乱理論入門 pp. 143-144 */
   for (i=0; i<sq->n; i++){
-    q = sq->x[i];
+    keisuu = 4.0 * M_PI * head->rho / sq->x[i];
-    keisuu = 4.0 * M_PI * head->rho / q;
     for (j=0; j<type->pairs; j++){
       sekibun = 0.0;
       for (k=0; k<gr->n; k++){  /* rで積分 */
-	r = gr->x[k];
+        sekibun = sekibun + gr->x[k] * (gr->y[k][j] - 1.0)*
-        sekibun = sekibun + r * (gr->y[k][j] - 1.0)* sin(q * r) * gr->dx;
+	  sin(sq->x[i] * gr->x[k]) * gr->dx;
       }
       sq_[i][j] = keisuu * sekibun;
     }