Ph.D. Student  ·  Chiba University

Ryuki Kayano

機械学習ポテンシャルと分子動力学シミュレーションを用いて、ガラス–水界面における原子スケールの反応機構を解明する研究を行っています。

Developing machine-learning interatomic potentials and apply molecular dynamics simulation to elucidate atomic-scale reaction mechanisms at glass–water interfaces.

Machine Learning Potentials Glass Science Interfacial Chemistry
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経歴と所属Affiliation

所属研究室:極限環境材料化学研究室(指導教官:大窪 貴洋 准教授)
その他:千葉大学大学院融合理工学府 先進科学プログラム(博士前期1.5年+博士後期2.5年)
Lab: Extreme Environment Materials Chemistry Lab (Supervisor: Assoc. Prof. Takahiro Ohkubo)
Program: Frontier Science Program, Chiba University (1.5-year M.Eng. + 2.5-year Ph.D.)

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連絡先と外部リンクContact

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受賞歴・フェローシップAwards & Fellowships

受賞Awards

フェローシップ・奨学金Fellowships & Scholarships

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スキル・ツールSkills & Tools

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プログラムの公開Open Programs

これまでの研究活動中で構築したプログラムのうち,利用できそうなものを公開しています。汎用的に使える指針で書いていないため,ご了承下さい。動作しない場合などはご一報いただけると幸いです。プログラムはGitHub上で公開しています。

Selected programs developed during my research are available on GitHub. These are not written as general-purpose libraries — please use at your own discretion, and feel free to reach out if something does not work.

dump2glassanalysis.py

LAMMPSのMDシミュレーションで得られたdump (.lammpstrj) ファイルから配位数とX-O-X (X: ネットワークフォーマー) の計算を行うプログラム。

Computes coordination numbers and X-O-X bond angles (X: network former) from LAMMPS MD dump (.lammpstrj) files.

./dump2glassanalysis.py example.lammpstrj -v

計算結果は時間平均されたものが標準出力と,Excelファイル (dump2analysis.xlsx) に出力されます。結合の有無を判断するカットオフ距離は if __name__ == "__main__": 以下で直接指定しています。例えば,リン酸ガラス中のP-Oの配位数を追加で求めたい場合は

Time-averaged results are written to stdout and an Excel file (dump2analysis.xlsx). Cutoff distances are set directly under if __name__ == "__main__":. To add P-O coordination in phosphate glass:

CUTOFF["P"] = 2.2  # P-O cutoff in Å

dump2glassdescript.py

LAMMPSのMDシミュレーションで得られたdumpファイルから,配位数,\(Q^n\),ガラス構造を表現する構造記述子を計算するプログラムです。

Computes coordination numbers, \(Q^n\) speciation, and structural descriptors from LAMMPS dump files.

./dump2glassdescript.py example.lammpstrj -v
CUTOFF["Si-O"] = 2.2  # Si-O cutoff in Å
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研究活動Research

出版物Publications

学会発表Presentations

国際学会・会議・シンポジウムInternational

国内の学会・会議・シンポジウムDomestic (Japan)