理科大の手跡くん滞在(続)

投稿者: | 2020年11月3日

さて、炭酸塩のMDについて試計算してみたのですが、文献を調べていたところ2015年に自由エネルギーを再現する新しいポテンシャルの論文が発表されていました。こちらを作成したスクリプトに組み込もうとしましたが、SIのデータセットに一部矛盾(なぜかCO3にdihedralが定義されOc-Ocがない)があります。著者に問い合わせたところすぐに返事がきてdihedralはbicarbonateの残骸でOc-Ocは記入ミスとのことでした。SrやBaもデータセットに追加されていたので、Sr入りでアモルファス炭酸塩の計算をしました。